The SETE (Theoretical and Experimental Ecology Station) is a Joint Research Unit of the National Center for Scientific Research (CNRS) and Paul Sabatier University in Toulouse. It is located in the foothills of the central Pyrenees in Ariège, in Moulis, about 100km south from Toulouse.

The laboratory was first founded in 1948 to study physical and biological aspects of underground cave systems. In 2007, it was turned into an experimental ecology station, and in 2016, it became the current Theoretical and Experimental Ecology Station (SETE).

Directed during this reconversion by Jean Clobert, by Michel Loreau since 2018, and now by Camille Parmesan,  it currently hosts a team of 70 researchers, technicians, administrative staff and PhD students.

The station focuses its research on exciting new developments in theoretical and experimental ecology, in particular on biodiversity, ecosystems and the interactions between human societies with a view to contributing to their long-term sustainability.

La SETE est situé à environ à 100km au sud de Toulouse.

Prendre l’A64 en direction de Tarbes.

Prendre la Sortie 20 direction St Girons.

Suivre la D117 jusqu’à St Girons, puis au premier rond-point à l’entrée de St Girons, prendre la 1ère sortie à droite en direction de Moulis.

Arrivé à Moulis, au rond-point, prendre la deuxième sortie pour aller au centre du village, et suivre le panneau ‘CNRS’.

Le trajet prend environ 1h15-1h30.

L’aéroport le plus proche est Toulouse-Blagnac.

En transport public, prendre une navette jusqu’à la Gare ferroviaire de Toulouse-Matabiau. De Toulouse-Matabiau, prendre un TER jusqu’à Boussens puis un bus jusqu’à St Girons.

Nous pouvons également envoyer une voiture ou taxi pour venir vous chercher.

Depuis la Gare de Toulouse-Matabiau, prendre un TER jusqu’à Boussens puis, un bus jusqu’à St Girons.

La Station est constituée de bâtiments modernes, entourés de vues panoramiques sur les montagnes et les forêts.

C'est un lieu idéal pour les visiteurs qui aiment la nature avec de nombreuses activités de plein air et une multitude de sites culturels à découvrir datant de l'époque romaine.

Pour plus d’information et renseignements, visitez le site de la Mairie de Moulis : https://mouliscouserans.wixsite.com/moulis

Theoretical and Experimental Ecology Station- CNRS UAR 2029
2 route du CNRS
09200 Moulis
France

+33 (0) 5 61 04 03 60

Objectifs

Nous visons à déterminer le rôle des réarrangements génomiques dans l'adaptation aux changements environnementaux. Le projet associe l'évolution expérimentale du Cilié Tetrahymena thermophila en microcosmes à la génération de cartes optiques, une technique de pointe permettant d'explorer l'organisation du génome (inversions, délétions, duplications). Nous essayons de relier les patrons adaptatifs en réponse au stress de salinité aux traits ciblés par la sélection (morphologie, mobilité) et aux mécanismes génomiques sous-jacents. Nous espérons ouvrir de nouvelles perspectives sur l'intégration de mécanismes moléculaires négligés dans la compréhension de l'évolution à des petites échelles de temps.

Financement

Responsables :

Delphine Legrand, Hervé Philippe and William Marande (CNRGV, INRA).

Participant :

Objectifs

Le nombre et la vitesse des changements d'origine anthropique imposent des pressions sélectives telles que la biodiversité est irréversiblement impactée. La plasticité et l'adaptabilité sont des processus éco-évolutifs qui peuvent limiter les pertes de biodiversité. Cependant, peu d'études ont évalué comment l'effet combiné de différents stress affecte la réponse immédiate et évolutive des organismes.

POLLUCLIM évaluera la réponse plastique à une augmentation de température et/ou à la présence de polluants sur un panel de génotypes d’un cilié en microcosmes. La probabilité d’adaptation face à ces stress sera ensuite mesurée, et nous déterminerons si l'exposition à un stress influence la réponse à un autre stress. Enfin, les patrons adaptatifs seront reliés aux backgrounds génétiques et à l'effet mutagène des stress.

POLLUCLIM devrait améliorer notre compréhension des patrons de tolérance et d'adaptabilité aux stress multiples d'origine anthropique, et des mécanismes moléculaires sous-jacents.

Financement

Responsable

Participants:

Objectifs

Des preuves de plus en plus nombreuses suggèrent que les individus qui choisissent de quitter un habitat sont souvent phénotypiquement différents de ceux qui restent. De plus, une installation dans des environnements qui maximisent leur fitness devrait être bénéfique à ces individus, ce qui créerait une covariation entre phénotypes et conditions environnementales. Les principales conséquences des décisions de dispersion, qui dépendent à la fois du phénotype et du contexte, ont été récemment développées dans le cadre de la théorie du choix de l'habitat.

Comparée à la dispersion aléatoire, cette théorie prédit que la dispersion basée sur le choix de l'habitat devrait générer une hétérogénéité spatiale des phénotypes et avoir ainsi des conséquences radicalement différentes pour une variété de dynamiques écologiques et évolutives telles que la distribution le long de l'aire de répartition et/ou la dynamique des métapopulations et l'adaptation locale. Cependant, notre compréhension de ce qui motive l'évolution du choix de l'habitat et des conséquences qui en découlent reste faible, notamment en raison du manque d'approches expérimentales dédiées au test des prédictions théoriques. Ce projet de recherche vise ainsi à identifier les causes environnementales de l'évolution du choix de l'habitat et à quantifier ses conséquences sur la dynamique écologique.

Pour ce faire, nous adopterons une approche expérimentale utilisant des microcosmes spatialement explicites chez une espèce de Cilié pratiquant de la dispersion active. Ce système expérimental offre une excellente occasion de valider des prédictions théoriques et ainsi de fournir des avancées majeures sur les causes environnementales et les conséquences de l'évolution de la dispersion.

Financement

Responsable :

Staffan Jacob

Participants:

Delphine Legrand, Michèle Huet, Alexis Chaine, Jean Clobert, Julie Campana

Objectifs

Les activités humaines altèrent profondément la biodiversité. Les lacs de montagne constituent des réservoirs d’eau importants à haute valeur patrimoniale.

Ils sont cependant particulièrement vulnérables à l’accumulation de pressions anthropiques, certains montrant des signes inquiétant d’eutrophisation. Ce projet a pour objectif de caractériser le rôle des protistes dans le processus d’eutrophisation de lacs pyrénéens à différentes échelles de temps et d’espace.

Grâce à une approche interdisciplinaire couplant métagénomique, metabarcoding, paléoécologie (étude de carottes sédimentaires) et expériences en microcosmes de protistes, nous cherchons à reconstruire la dynamique et le fonctionnement de ces écosystèmes.

Responsables :

Participants:

Objectifs

Les interactions entre organismes affectent la diversité des gènes et des écosystèmes. Étant donné que la plupart des espèces sont constamment mises à l'épreuve par les micro-organismes mutualistes et parasitaires, nous proposons que le mutualisme et le parasitisme pourraient s'influencer mutuellement.

En utilisant les plantes comme modèle, nous combinerons nos expertises complémentaires pour tester l'hypothèse que le parasitisme et le mutualisme ont un impact mutuel sur l'évolution. Pour ce faire, nous proposons d'abord (LRSV) d'identifier les gènes impliqués dans le parasitisme ou le mutualisme à l'aide d'approches génomiques (GWAS, scans de sélection) et de comparer leur évolution au sein des espèces de deux clades divergents de plantes terrestres (Angiospermes et Hépatiques), y compris pour des espèces qui ont récemment perdu un mutualisme important (par exemple, Arabidopsis thaliana et Marchantia polymorpha).

Responsables :

Participant :

Objectifs

Le développement exponentiel de l’activité humaine au cours des deux derniers siècles a profondément modifié l’environnement dans lequel nous vivons. En particulier, l’urbanisation, l’industrialisation et l’agriculture intensive ont généré, et génèrent encore, diverses formes de pollution qui jouent un rôle majeur dans la perte de la biodiversité et le réchauffement climatique observé mondialement.

Pour mener des politiques environnementales de conservation et de développement durable, il est indispensable de comprendre par quels mécanismes la pollution produite par l’activité humaine contribue à la dégradation des écosystèmes. Ceci requiert de pouvoir à la fois quantifier les différents types de pollutions présentes et les réponses des organismes face à ces stress environnementaux de manière fine et intégrative. Il n’existe actuellement pas d’outils permettant de relever ce défi à l’échelle d’un territoire entier.

Avec Econect, nous proposons de développer de nouveaux systèmes sentinelles de l'environnement et de les déployer en Occitanie. Ces véritables laboratoires de terrain, autonomes, connectés et évolutifs, pourront à la fois mesurer la pollution présente dans l’eau, l’air ou les sols et la réponse à ces stress d’organismes bio-indicateurs (algues d’eau douce, abeille domestique et mésange charbonnière). Les défis technologiques et l’innovation liés à ce projet tiennent au développement de nouveaux capteurs, à la récupération automatique et à distance des données, et à la gestion d’un flux continu et massif de données.

Pour plus d’information: econect.cnrs.fr

Video de presentation du projet : https://youtu.be/NgFoq1XnukE

Financement

Porteurs :

Pls :

Participants de la SETE :

Objectifs

L'urbanisation impose des pressions de sélection importantes sur les organismes, mais notre compréhension des pressions anthropique s'appuie souvent sur des études à petite échelle qui se concentrent sur une population et un impact. Dans ce projet, nous avons créé un réseau de laboratoires en France pour étudier les impacts anthropiques chez un oiseau chanteur commun, la mésange charbonnière, à travers 6 paires de populations urbaines-rurales répliquées.

Nous mesurerons directement la pollution de chaque site (métaux lourds, pesticides) ainsi que la condition physique globale, caractériserons le microbiome et rechercherons les signatures génétiques de la sélection passée associée à l'urbanisation. De plus, nous effectuerons des études expérimentales pour examiner l'impact de l'urbanisation sur les performances cognitives dans la nature et comment la pollution lumineuse et sonore affecte les performances cognitives en captivité. Cette étude fournira une évaluation à plus grande échelle de l'impact de la pollution anthropique sur les oiseaux chanteurs.

Financement

Responsables :

Sylvie Massemin PI (U. Strasbourg), Alexis Chaine (SETE) and Philipp Heeb (Toulouse) sont co-PIs avec 5 autres laboratoires

Participants de la Sete:

Objectifs

Les capacités cognitives sont essentielles à de nombreuses interactions sociales, mais peu d'études ont examiné le lien entre la plasticité sociale (appelée compétence sociale) et les performances cognitives. Dans cette étude, nous examinerons la relation entre la variation inter-individuelle de la plasticité sociale et la performance à des tâches cognitives spécifiques à travers un gradient écologique (gradient d'altitude de 1000 m).

De plus, nous examinerons comment la variation de la cognition et de la compétence sociale influe la fitness dans la nature et si cet effet est médié par le comportement parental. Enfin, nous examinerons la base génétique de la variation des performances cognitives et des compétences sociales.

Pour atteindre ces objectifs, nous utiliserons une combinaison d'expériences dans les volières de la SETE ainsi que des expériences sur le terrain en utilisant un dispositif de test cognitif nouvellement développé. Cette étude fournira une nouvelle perspective sur la façon dont la cognition et la plasticité sociale interagissent ainsi que sur les causes et les conséquences de la variation interindividuelle de ces traits.

Financements

Responsables :

A. Chaine (SETE) ; Co-PIs : A. Charmantier (Montpellier), P. Heeb (Toulouse), N. Claidière (Aix en Provence)

Participants à la SETE :

Objectifs

Pour s’adapter au réchauffement climatique et à l’augmentation constante de l’activité anthropique (pollution, urbanisation, agriculture intensive, fragmentation du paysage), les animaux sauvages doivent développer de nouvelles stratégies comportementales. Ici, on se concentre sur les oiseaux du groupe passereaux qui sont en constante diminution et qui jouent un rôle clé dans la biodiversité des campagnes, la prévention des pestes agricoles et le fonctionnement des écosystèmes. Une des questions primordiales à laquelle les chercheurs en écologie font actuellement face est de savoir comment les animaux ajustent leurs mouvements aux nouvelles modifications de leur environnement lié à l’activité anthropique. Néanmoins, notre compréhension du comportement des passereaux dans leur milieu naturel, et notamment face à l’activité anthropique, reste limitée puisse que des outils pour suivre les petits passereaux n’existe pas à l’heure actuelle.

Financement

Responsables :

PIs : Philipp Heeb (Toulouse) est le PI avec Xerius Microsystems comme partenaire du secteur privé ; co-PIs : Alexis Chaine (SETE) et A. Gregoire (Montpellier)

Participants de la SETE :

Objectifs

La variation entre les individus au sein d'une espèce, en particulier dans les traits de couleur, a attiré une attention particulière depuis que les premiers explorateurs et naturalistes ont ramené des spécimens des confins du monde. Pourtant, la façon dont la variation est maintenue au sein des populations présente toujours un casse-tête scientifique, car la sélection naturelle ou sociale devrait réduire la variation au sein des populations, sauf s'il y a des avantages compensatoires.

Les yeux gris blancs de l'île de la Réunion montrent un polymorphisme de couleur qui est stable depuis plus de 50 ans. Nous fournissons ici une nouvelle description plus nuancée de ce polymorphisme de couleur et en étudions la base génétique du polymorphisme de couleur ainsi que la façon dont la sélection agit sur chaque morphe à travers la résistance aux parasites, le succès de reproduction et les interactions sociales.

Financement

Responsables :

PIs : Alexis Chaine (SETE) et Christophe Thébaud (Toulouse)

Participants à la SETE :

Objectifs

Tous les réseaux d’interactions sociales ont une composition en individus variable au fil du temps : les individus sont perdus par la mort ou la dispersion, et de nouveaux individus rejoignent le réseau social par la naissance et l'immigration.

Pourtant, nous ne savons presque rien sur la façon dont ce processus universel de rotation de la population façonne la structure des réseaux sociaux, et nous ne comprenons pas comment les réseaux sociaux peuvent ou non être résistants au turnover au sein des populations. Dans ce projet, nous développons une nouvelle théorie sur l'impact du turnover sur les réseaux sociaux et confrontons ces modèles à des données empiriques à long terme sur le réseau social de Zonotrichia atricapilla.

Financement

Responsables :

Objectifs

OPCC ADAPYR est le projet fédérateur des Pyrénées en matière d'observation, de capitalisation et de transfert des connaissances et des bonnes pratiques d'adaptation au changement climatique. Ses objectifs sont de systématiser le suivi des impacts climatiques dans les Pyrénées et de définir une stratégie d'adaptation pyrénéenne au changement climatique.

Avec la CTP, 12 organisations bénéficiaires et 30 organisations partenaires de tout le territoire pyrénéen apporteront et partageront leurs connaissances et leurs travaux sur les impacts, la vulnérabilité et l'adaptation au changement climatique dans divers domaines tels que la flore, la faune, les lacs et les tourbières, les glaciers, les forêts, les forêts, les bassins versants, les risques naturels ou l'étude du climat. Le partenaire SETE, représentée par Fabien Aubret (Chargé de Recherche), étudie dans le cadre d'ADAPYR les effets du changement climatique sur l'écologie d'un lézard endémique des Pyrénées, le lézard de Bonnal). Les lézards Iberolacerta sont endémiques des Pyrénées, inscrits sur la liste rouge mondiale IUCN (2015) et bénéficie d’un Plan National d’Action porte par Nature Midi-Pyrénées (NMP). La répartition mondiale de ce lézard est entièrement comprise entre l'Andorre, la Catalogne et la France.

https://www.opcc-ctp.org/es/proyecto/opcc-adapyr

https://www.opcc-ctp.org/fr/proyecto/opcc-adapyr

Financement

Responsables :

Objectives

Climate change is driving many species to migrate along the altitudinal gradient of mountainous landscapes. While the impacts of temperature shift on range expansion are well established, the effects of altitude-related hypoxia on the ability of organisms to colonize and adapt to higher altitudes during warming have, to our knowledge, not received scientific interest. Specifically, the short, medium and long term effects of acute and chronic hypoxia on the growth, survival, reproductive biology and colonization dynamics of animals reaching higher altitude refuges remain unknown. PODARCIS will generate such knowledge, via a detailed study of physiological responses to hypoxia across an altitudinal gradient in a species that undergoes upward range expansion, the wall lizard Podarcis muralis. PODARCIS will

(1) assess multivariate acclimation responses in embryos and adult lizards from low to high altitude using common garden and reciprocal transplant experiments (i.e. to assess the effectiveness for plastic responses to enable colonization and detect changes in the degree of plasticity across the altitudinal gradient) and

Funding

Leaders

Objectives

The Pyrenees are increasingly affected by climate change. In this context, human societies across the borders must keep track of and adapt to the changes. ECTOPYR offers a novel and ambitious strategy in this regard; that is to use a panel of 8 ectotherm organisms as bio-indicators of climate change, occurring from low-land streams to high-altitude rock-fields. ECTOPYR will generate range maps for each model organism in order to rapidly

(1) assess each bio-indicator’s response to climate change,

(2) describe the natural variability of the Pyrenees’ climate over vast time scales and

(3)generate modelling tools in order to anticipate the effects of climate change on each model organisms.

These advances will serve decision making towards a sustainable future across the various mountainous environments, as well as thoroughly understand ecosystem functioning in the Pyrenees. These achievements will benefit environment managers, entrepreneurs, the scientific community as well as the general public. ECTOPYR will be a stepping stone towards a sustainable future in the Pyrenees, and will make people, managers and communities feel and work closer together.

Video : https://www.youtube.com/watch?v=VyDrQSzDSMs        

Funding

Leader

Objectifs

Impact de l'urbanisation sur les serpents tigres dans les zones humides de Perth et ses environs. Ce projet de recherche (Thèse de Doctorat) mesure si et comment la dégradation de l'environnement par l'urbanisation et la pollution rend les vertébrés des zones humides plus sensibles aux maladies et aux parasites, en comparant l’état sanitaire et l'écologie de populations de serpents tigres le long de gradients géographiques et historiques.

Ce projet évalue la dégradation de la santé des zones humides (structure de l'habitat et qualité de l'eau) à travers une matrice urbaine afin de déterminer les effets de la bioaccumulation des contaminants, les effets de la dégradation des zones humides sur le parasitisme et intègre toutes les informations pour déterminer si les serpents tigres peuvent être utilisés comme indicateur écologique de la santé des zones humides. 

Financement

Université de Curtin, Perth, Western Australia

Responsables :

Objectifs

Le changement climatique modifie les conditions thermiques et la disponibilité de l'eau dans le temps et l'espace, ce qui perturbe les performances physiologiques des animaux ectothermes et pourrait pousser certaines de leurs populations sur une trajectoire rapide d'extinction. La sensibilité, la résilience et le potentiel adaptatif des ectothermes face au changement climatique sont largement déterminés par leurs capacités et tolérances physiologiques et comportementales. Les réponses individuelles aux changements des conditions thermiques et de la disponibilité de l'eau in situ dépendent spécifiquement de la thermorégulation (c'est-à-dire la régulation physiologique et comportementale de la température corporelle) et de l'hydrorégulation (c'est-à-dire la régulation physiologique et comportementale du budget hydrique).

Chez les ectothermes, les réponses aux contraintes hydriques restent peu étudiées dans le cadre du changement climatique. On s'attend de plus à ce que l'hydrorégulation et la thermorégulation interagissent via des relations causales complexes, éventuellement antagonistes, conduisant à des réponses écologiques au changement climatique difficiles à prévoir en se focalisant uniquement sur la biologie thermique. Comment ces interactions entre la thermorégulation et l'hydrorégulation influencent la vulnérabilité au changement climatique demeure pratiquement inconnue car nous manquons d'études qui examinent conjointement les stratégies d'hydro- et de thermorégulation impliquées. Une approche prometteuse et globale pour aborder ce problème consiste à utiliser des modèles biophysiques du budget de l'énergie et de l'eau suffisamment généraux pour s'appliquer à une large gamme de systèmes d'études. Ici, nous utiliserons l'écophysiologie et l'écologie comportementale pour améliorer notre compréhension de ce problème critique chez les ectothermes terrestres.

Financement

Leaders

Objectifs

Cette proposition s'articule autour de deux questions essentielles:

1) comment les polymorphismes de couleur apparaissent? et

2) comment sont-ils maintenus? Ce projet utilisera le lézard des murailles, Podarcis muralis, comme modèle pour répondre à ces des questions.

Financement

Responsables :

Objectifs

Responsables :

Dr Vicki Thomson (University of Adelaide, Australia) et Fabien Aubret (SETE)